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◇ 中华系列
文章类型：
机构：
[1]温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室
[2]首都医科大学附属北京胸科医院
[3]北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室
出处：
ISSN：
关键词：
结核分枝杆菌
长序列多态性
欧美谱系
群体遗传学
摘要：
目的探讨四川盆地（重庆、四川地区）流行的结核分枝杆菌（MTB）群体遗传学特征。方法对413株源自四川盆地的MTB进行长序列多态性（LSP）谱系鉴定,采用x2检验分析不同谱系MTB在人群中的分布差异。对菌株进行15位点数目可变串联重复序列基因分型,评价各位点的分辨力。构建N-J树分析其系统进化;构建最小跨度树以模拟群体菌株的遗传结构;采用分子方差分析不同谱系MTB的群体间遗传分化;采用贝叶斯模型计算菌株最近共祖年代。结果通过LSP可将413株MTB分为两大谱系,其中北京谱系占56.2%（232/413）,欧美谱系占43.8%（181/413）。两谱系MTB在人群中的分布（性别、年龄、民族以及菌株耐药性）差异无统计学意义（P>0.05）。北京谱系MTB的N-J树呈放射状分布,最小跨度树中有72.4%（168/232）的菌株被划分到同一"克隆复合群";欧美谱系MTB的N-J树呈枝状分布,最小跨度树中呈现出多个"克隆复合群"。北京谱系MTB在该地区有显著的群体间遗传分化(TST=0.018 91,P<0.05),而欧美谱系MTB群体间遗传分化不显著(FST=0.005 19,P>0.05)。欧美谱系MTB中最大菌株复合群的最近共祖年代为723（95%CI:517946）年。结论北京谱系和欧美谱系MTB在四川盆地以"互相对抗"形式流行;两谱系MTB的群体间遗传分化存在差异;欧美谱系MTB的侵入可能与一次历史事件（约720年前的战争）有关
基金：
国家自然科学基金（81273144）； 北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养计划项目（20133041）~~；
PubmedID：
第一作者：
第一作者机构：
[1]温州医科大学检验医学院生命科学学院浙江省模式生物技术与应用重点实验室
通讯作者：
通讯机构：
[2]首都医科大学附属北京胸科医院
[3]北京市结核病胸部肿瘤研究所国家结核病临床实验室
推荐引用方式(GB/T 7714)：
李颖,付育红,原梅,等.四川盆地结核分枝杆菌群体遗传学特征研究[J].Chinese Journal of Epidemiology.2015,36(4):374-8.
