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Pubmed体系:
收录情况:
◇ 统计源期刊
◇ 北大核心
◇ CSCD-C
文章类型:
机构:
[1]四川大学华西医院消化外科研究室
四川大学华西医院
出处:
ISSN:
关键词:
TaqMan探针
实时荧光PCR
单核苷酸多态性
摘要:
目的建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAPIO基因2073A/GSNP的检测。方法设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAPIO基因2073A/GSNP进行分型。同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果。结果运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAPIO基因2073A/GSNP检测结果准确,与PCR产物的直接测序结果完全一致。AKAPIO基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P〉0.05)。非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52,95%CI:1.07~2.15。P=0.019)。结论通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台。AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性。
基金:
国家自然科学基金(批准号3057181);美国中华医学基金(No.CMB96636)资助
PubmedID:
第一作者:
第一作者机构:
[1]四川大学华西医院消化外科研究室
通讯作者:
推荐引用方式(GB/T 7714):
王默进,周总光,王玲,等.运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073AG单核苷酸多态性[J].Journal of Sichuan University(Medical Science Edition).2009,40(2):275-8.