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运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073AG单核苷酸多态性

[Genotyping of AKAP10 gene 2073A/G single nucleotide polymorphism by TaqMan probe real-time PCR].

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收录情况: ◇ 统计源期刊 ◇ 北大核心 ◇ CSCD-C

机构: [1]四川大学华西医院消化外科研究室
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关键词: TaqMan探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性

摘要:
目的建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAPIO基因2073A/GSNP的检测。方法设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAPIO基因2073A/GSNP进行分型。同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果。结果运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAPIO基因2073A/GSNP检测结果准确,与PCR产物的直接测序结果完全一致。AKAPIO基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P〉0.05)。非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52,95%CI:1.07~2.15。P=0.019)。结论通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台。AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性。

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第一作者机构: [1]四川大学华西医院消化外科研究室
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