高级检索
当前位置: 首页 > 详情页

基于机器学习的食管癌程序性细胞死亡相关基因预后模型的构建与应用

Development of a machine learning-based programmed cell death related genes prog-nostic model for esophageal carcinoma

| 认领 | 导出 |

文献详情

资源类型:
机构: [1]四川省肿瘤医院胸外科,四川 成都 610041 [2]重庆医科大学,重庆 400016 [3]电子科技大学医学院,四川 成都 610054 [4]四川省人民医院肿瘤科,四川 成都 610072
出处:
ISSN:

关键词: 食管癌 机器学习 程序性细胞死亡 预后模型 免疫疗法

摘要:
目的:通过生物信息学方法评估程序性细胞死亡相关基因(programmed cell death related genes, PCDRGs)在食管癌(esophageal carcinoma, EC)中的预后价值,并从多个角度探索EC的发生发展机制及其免疫调节特性。方法:利用TCGA和GSE53622数据集,并结合下载的18种PCDRGs,结合10种不同的机器学习方法开发一种全新的预测模型,命名为“细胞死亡特征”(characteristics of cell deaths, CDS)。通过模型筛选出7个与预后显著相关的基因,并对其与EC的关系进行了深入分析。结果:使用StepCox[both]+RSF方法开发的PCDRGs预后模型显示了最优性能。CDS模型在预测EC患者的临床结果方面表现出显著的效能,并在TCGA和GEO数据集中被证明为独立的风险预测因子。结论:本研究成功构建了一种新型的EC PCDRGs预测模型。该模型在进一步验证后,有望用于预测EC患者的预后及药物治疗的敏感性。

基金:

基金编号: 编号:82472663

语种:
第一作者:
第一作者机构: [1]四川省肿瘤医院胸外科,四川 成都 610041 [2]重庆医科大学,重庆 400016 [3]电子科技大学医学院,四川 成都 610054
通讯作者:
通讯机构: [1]四川省肿瘤医院胸外科,四川 成都 610041 [3]电子科技大学医学院,四川 成都 610054
推荐引用方式(GB/T 7714):

资源点击量:65764 今日访问量:2 总访问量:5150 更新日期:2025-12-01 建议使用谷歌、火狐浏览器 常见问题

版权所有©2020 四川省肿瘤医院 技术支持:重庆聚合科技有限公司 地址:成都市人民南路四段55号