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本发明公开了一种基于多色免疫荧光的三级淋巴结构成熟度识别方法,属于图像识别技术领域,包括如下步骤:获取肿瘤患者石蜡样本切片;对肿瘤患者石蜡样本切片进行染色,得到第一染色切片和第二染色切片;对第一染色切片和第二染色切片进行全景扫描和特征配准,得到特征配准后的第一全景片和第二全景片;基于第一特征提取网络和第二特征提取网络对应提取特征配准后的第一全景片和第二全景片的三级淋巴结构区域,并通过误差特征区域筛除,得到标记有若干三级淋巴结构区域的待识别多色免疫荧光图;基于待用多色免疫荧光图进行三级淋巴结构成熟度识别,得到三级淋巴结构成熟度识别结果。本发明解决了难以快速、准确地识别成熟三级淋巴结构的问题。
主权项:
1.一种基于多色免疫荧光的三级淋巴结构成熟度识别方法,其特征在于,包括如下步骤: S1、获取肿瘤患者石蜡样本切片; S2、对肿瘤患者石蜡样本切片进行染色,得到第一染色切片和第二染色切片; 所述S2包括如下步骤: S21、根据预设厚度对石蜡样本进行切片,并任意选取连续的两份切片; S22、对选取的第一份切片进行多色免疫荧光染色,得到第一染色切片; S23、对选取的第二份切片进行苏木精-伊红染色,得到第二染色切片; S3、观察第二染色切片,并判断第二染色切片中是否有裂纹,若是则返回S1,否则进入S4; S4、对第一染色切片和第二染色切片进行全景扫描和特征配准,得到特征配准后的第一全景片和第二全景片; S5、基于第一特征提取网络和第二特征提取网络对应提取特征配准后的第一全景片和第二全景片的三级淋巴结构区域,并通过误差特征区域筛除,得到标记有若干三级淋巴结构区域的待识别多色免疫荧光图; 所述S5包括如下步骤: S51、获取染色切片全景片数据集,其中,染色切片全景片数据集包括由若干第一染色切片的全景片构成的第一染色切片全景片子数据集,以及由若干第二染色切片的全景片构成的第二染色切片全景片子数据集; S52、分别构建第一特征提取网络和第二特征提取网络; S53、利用第一染色切片全景片数据集训练第一特征提取网络,得到训练后的第一特征提取网络; S54、利用第二染色切片全景片数据集训练第二特征提取网络,得到训练后的第二特征提取网络; S55、利用训练后的第一特征提取网络提取特征配准后的第一全景片的三级淋巴结构区域,并作为第一数字化特征; S56、利用训练后的第二特征提取网络提取特征配准后的第二全景片的三级淋巴结构区域,并作为第二数字化特征; S57、查找第二数字化特征中不完整的三级淋巴结构区域,并将查找的结果对应的第一数字化特征中的区域作为误差特征; S58、筛除第一数字化特征中的误差特征,得到标记有若干三级淋巴结构区域的待识别多色免疫荧光图; S6、基于待用多色免疫荧光图进行三级淋巴结构成熟度识别,得到三级淋巴结构成熟度识别结果; 所述S6包括如下步骤: S61、分别对待识别多色免疫荧光图标记的各三级淋巴结构区域中呈阳性的T细胞CD3、B细胞CD20和滤泡细胞CD21进行聚集趋势分析,得到标记的各三级淋巴结构区域中的细胞聚集趋势信息; S62、分别对待识别多色免疫荧光图标记的各三级淋巴结构区域中呈阳性的T细胞CD3、B细胞CD20和滤泡细胞CD21进行组织结构分类,得到若干呈第一类组织结构的三级淋巴结构区域和若干呈第二类组织结构的三级淋巴结构区域; 所述S62中第一类组织结构为包括呈阳性的滤泡细胞CD21、呈阳性的B细胞CD20和呈阳性的T细胞CD3; 所述S62中第二组织结构为仅包括呈阳性的B细胞CD20和呈阳性的T细胞CD3; S63、分别对待识别多色免疫荧光图标记的各三级淋巴结构区域中呈阳性的T细胞CD3、B细胞CD20和滤泡细胞CD21进行组织结构形式分析,得到标记的各三级淋巴结构区域中的各类细胞数量信息; S64、分别对待识别多色免疫荧光图标记的各三级淋巴结构区域中呈阳性的T细胞CD3、B细胞CD20和滤泡细胞CD21进行相互作用分析,得到标记的各三级淋巴结构区域中的各类细胞间的距离信息; S65、基于标记的各三级淋巴结构区域中的细胞聚集趋势信息、各类细胞数量信息和各类细胞间的距离信息,分别对各呈第一类组织结构的三级淋巴结构区域和各呈第二类组织结构的三级淋巴结构区域进行三级淋巴结构成熟度识别,得到三级淋巴结构成熟度识别结果; 所述S65包括如下步骤: S651、针对各呈第一类组织结构的三级淋巴结构区域,若区域内呈阳性的滤泡细胞CD21的数量超过第一预设细胞数量阈值时,则该第一类组织结构的三级淋巴结构区域为成熟的三级淋巴结构区域; S652、针对各呈第一类组织结构的三级淋巴结构区域,若区域内呈阳性的滤泡细胞CD21的数量不超过第一预设细胞数量阈值时,则判断区域内呈阳性的T细胞CD3和B细胞CD20是否分别呈显著的聚集趋势、数量均大于第二预设细胞数量阈值,且各T细胞CD3间的平均距离和各B细胞CD20间的平均距离均不超过第一预设距离阈值,若是则该第一类组织结构的三级淋巴结构区域为成熟的三级淋巴结构区域,否则该第一类组织结构的三级淋巴结构区域为不成熟的三级淋巴结构区域; S653、针对各呈第二类组织结构的三级淋巴结构区域,若区域内呈阳性的T细胞CD3和B细胞CD20间各自呈聚集趋势,则判断T细胞CD3和B细胞CD20的数量是否均大于第二预设细胞数量阈值,且各T细胞CD3间的平均距离和各B细胞CD20间的平均距离均不超过第一预设距离阈值,若是则该第二类组织结构的三级淋巴结构区域为成熟的三级淋巴结构区域,否则该第二类组织结构的三级淋巴结构区域为不成熟的三级淋巴结构区域; S654、针对各呈第二类组织结构的三级淋巴结构区域,若区域内呈阳性的T细胞CD3和B细胞CD20间各自均不呈聚集趋势,则该第二类组织结构的三级淋巴结构区域为不成熟的三级淋巴结构区域。