本发明公开了一种基于非靶向代谢组学检测GIST患者血浆中伊马替尼代谢物的方法,采集若干名未服用及长期规律服用I M的GIST患者外周静脉血,进行处理后,采用UPLC‑QTOF/MS联用技术对待测样本进行非靶向检测,得到血浆中的代谢物原始数据,对原始数据进行无监督主成分分析分析(PCA)、正交偏最小二乘法判别分析(OPLS‑DA)、Student’s t‑test和差异倍数分析(Fo l dChange),并寻找差异代谢物,检索数据库定性出G I ST代谢标志物。为适用于I M治疗的G I S I患者的有效性治疗提供技术支撑,可为消化道肿瘤确诊后的药物治疗有效性、针对性及无创筛选、标志物表征奠定基础。