背景与目的：食管癌术后辅助化疗主要针对淋巴结转移灶，但转移灶中肿瘤细胞群多药耐药(multidrug resistance，MDR)的异质性是影响化疗效果的一个主要因素。目前有关食管鳞癌MDR的研究多限于肿瘤原发灶，其原发灶与淋巴结转移灶MDR是否存在异质性鲜见报道。本研究探讨MDR相关蛋白在食管鳞癌原发灶与淋巴结转移灶中的差异表达及意义。方法：对54例食管胸段鳞癌原发灶及相应淋巴结转移灶分别进行MDR相关蛋白肺耐药相关蛋白(LRP)、P-糖蛋白(P-gp)、拓扑异构酶Ⅱ(TOPO-Ⅱ)、胸甘酸合成酶(TS)、谷胱甘肽-S-转移酶(GST-π)免疫组织化学染色，比较同一患者MDR相关蛋白在肿瘤原发灶和淋巴结转移灶中表达和耐药的差异，分析其与组织分化程度的关系。结果：肿瘤原发灶与淋巴结转移灶LRP、P-gp、TS、TOPO-Ⅱ、GST-π表达和耐药不一致率分别为63.0%和26.9%、42.6%和22.2%、48.1%和25.9%、50.0%和29.6%、18.5%和1.9%。LRP在原发灶与淋巴结转移灶的表达差异有统计学意义(P=0.026)，其余4种蛋白在原发灶与淋巴结转移灶的表达没有差异，GST-π在原发灶与淋巴结转移灶中均表达。MDR相关蛋白表达与组织分化程度无关。结论：食管鳞癌原发灶与淋巴结转移灶存在MDR的异质性现象。对淋巴结转移灶检测MDR相关蛋白表达水平有助于指导食管鳞癌术后选择合理的化疗方案。